WebsiteImExporterを使って画像をインポートしたところ、ZIP内のファイル名と異なる名前（例：site_upload_xxxxx.png）で登録されました。これは不具合ですか？

不具合ではなく仕様です。
同名ファイルとの重複を避けるため、インポート時にファイル名が自動でリネームされる場合があります。

（SUPPORT_MTP-1821）