クラウド版の初期ドメインのまま、サイトや管理画面をSSL化できますか？

はい、可能です。
Movable Type Premium クラウド版では、提供される初期ドメイン（xxxx.movabletype.biz など）は標準でSSL化（HTTPS対応）済みです。
そのため、Let's Encrypt の設定や独自ドメインの取得を行わなくても、初期ドメインのままサイトや管理画面を安全にご利用いただけます。

特にCMS用途として独自ドメインを割り当てない場合でも、そのままHTTPSでアクセスいただけますので追加の設定は不要です。

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