ZIP内に images/ フォルダを作って画像をまとめています。 WebsiteImExporterでインポート時に、この階層をそのまま子サイト側に反映させることはできますか？

はい、可能です。ZIP内のフォルダ構成はそのまま再現されます。
ただし、HTML内のパス指定がZIP内の階層と対応している必要があります。

正しい構成例

▼ZIP構成

import.zip
├ article.html
└ images/
     └ photo.png

import.zip
├ article.html
└ images/
     └ photo.png

▼HTML記述

<img src="/images/photo.png" alt="">

<img src="/images/photo.png" alt="">

これで、インポート時に子サイト配下へ images/photo.png として登録されます。

注意点

• 相対パス（例：images/photo.png）は認識されないことがあります。

• /images/photo.png または絶対URLで記述してください。

• 子サイトのアセット設定・権限も正しく設定しておきましょう。

（SUPPORT_MTP-1821）